| 學名 由大到小 | 中文名 | 階層 | 類群 | 科 | 綱 | 界 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Chromulinales | 色金藻目 | order | 原藻類 | -- | 金藻綱 | 原藻界 |
| Chrysophyceae | 金藻綱 | class | 原藻類 | -- | 金藻綱 | 原藻界 |
| Cladophoraceae | 剛毛藻科 | family | 原藻類 | 剛毛藻科 | 石蓴綱 | 泛植物界 |
| Cladophorales | 剛毛藻目 | order | 原藻類 | -- | 石蓴綱 | 泛植物界 |
| Climacospheniaceae | 梯楔藻科 | family | 原藻類 | 梯楔藻科 | 中型矽藻綱 | 原藻界 |
| Coccolithales | 顆石藻目 | order | 原藻類 | -- | 顆石藻綱 | 原藻界 |
| Coccolithophyceae | 顆石藻綱 | class | 原藻類 | -- | 顆石藻綱 | 原藻界 |
| Coccolithophyceae familia incertae sedis | family | 原藻類 | Coccolithophyceae familia incertae sedis | 定鞭藻綱 | 原藻界 | |
| Cocconeidaceae | 卵形藻科 | family | 原藻類 | 卵形藻科 | 矽藻綱 | 原藻界 |
| Cocconeidales | 卵形藻目 | order | 原藻類 | -- | 矽藻綱 | 原藻界 |
| Coccosphaerales | 卵球藻目 | order | 原藻類 | -- | 定鞭藻綱 | 原藻界 |
| Codiaceae | 松藻科 | family | 原藻類 | 松藻科 | 石蓴綱 | 泛植物界 |
| Coelastraceae | 空星藻科 | family | 原藻類 | 空星藻科 | 綠藻植物綱 | 泛植物界 |
| Corallinales | 珊瑚藻目 | order | 原藻類 | -- | 真紅藻綱 | 泛植物界 |
| Coscinodiscaceae | 圓篩藻科 | family | 原藻類 | 圓篩藻科 | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Coscinodiscales | 圓篩藻目 | order | 原藻類 | -- | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Coscinodiscophyceae | 圓篩藻綱 | class | 原藻類 | -- | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Cryptista | 隱藻門 | phylum | 原藻類 | -- | -- | 原藻界 |
| Cryptomonadaceae | 隱鞭藻科 | family | 原藻類 | 隱鞭藻科 | 隱藻綱 | 原藻界 |
| Cryptomonadales | 隱鞭藻目 | order | 原藻類 | -- | 隱藻綱 | 原藻界 |
| Cryptophyceae | 隱藻綱 | class | 原藻類 | -- | 隱藻綱 | 原藻界 |
| Cymatosiraceae | 波紋藻科 | family | 原藻類 | 波紋藻科 | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Cymatosirales | 波紋藻目 | order | 原藻類 | -- | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Cymbellaceae | 橋彎藻科 | family | 原藻類 | 橋彎藻科 | 矽藻綱 | 原藻界 |
| Cymbellales | 橋彎藻目 | order | 原藻類 | -- | 矽藻綱 | 原藻界 |