| 學名 由大到小 | 中文名 | 階層 | 類群 | 科 | 綱 | 界 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Rhaphoneidaceae | 縫舟藻科 | family | 原藻類 | 縫舟藻科 | 矽藻綱 | 原藻界 |
| Rhaphoneidales | 縫舟藻目 | order | 原藻類 | -- | 矽藻綱 | 原藻界 |
| Rhizosoleniaceae | 根管藻科 | family | 原藻類 | 根管藻科 | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Rhizosoleniales | 根管藻目 | order | 原藻類 | -- | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Rhodomelaceae | 松節藻科 | family | 原藻類 | 松節藻科 | 真紅藻綱 | 泛植物界 |
| Rhodophyta | 紅藻植物門 | phylum | 原藻類 | -- | -- | 泛植物界 |
| Rhoicospheniaceae | 彎契藻科 | family | 原藻類 | 彎契藻科 | 矽藻綱 | 原藻界 |
| Rhopalodiaceae | 棒杆藻科 | family | 原藻類 | 棒杆藻科 | 矽藻綱 | 原藻界 |
| Rhopalodiales | 棒杆藻目 | order | 原藻類 | -- | 矽藻綱 | 原藻界 |
| Saprolegniaceae | 水黴科 | family | 原藻類 | 水黴科 | 霜黴綱 | 原藻界 |
| Saprolegniales | 水黴目 | order | 原藻類 | -- | 霜黴綱 | 原藻界 |
| Sargassaceae | 馬尾藻科 | family | 原藻類 | 馬尾藻科 | 褐藻綱 | 原藻界 |
| Scenedesmaceae | 柵藻科 | family | 原藻類 | 柵藻科 | 綠藻植物綱 | 泛植物界 |
| Schimmelmanniaceae | 泥影藻科 | family | 原藻類 | 泥影藻科 | 真紅藻綱 | 泛植物界 |
| Scytosiphonaceae | 萱藻科 | family | 原藻類 | 萱藻科 | 褐藻綱 | 原藻界 |
| Scytothamnales | 革灌藻目 | order | 原藻類 | -- | 褐藻綱 | 原藻界 |
| Siphonocladaceae | 管枝藻科 | family | 原藻類 | 管枝藻科 | 石蓴綱 | 泛植物界 |
| Skeletonemaceae | 骨條藻科 | family | 原藻類 | 骨條藻科 | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Sphacelariaceae | 黑頂藻科 | family | 原藻類 | 黑頂藻科 | 褐藻綱 | 原藻界 |
| Sphacelariales | 黑頂藻目 | order | 原藻類 | -- | 褐藻綱 | 原藻界 |
| Sphaeropleales | 環藻目 | order | 原藻類 | -- | 綠藻植物綱 | 泛植物界 |
| Staurosiraceae | 十字脆杆藻科 | family | 原藻類 | 十字脆杆藻科 | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Stictodiscaceae | 斑盤藻科 | family | 原藻類 | 斑盤藻科 | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Stictodiscales | 斑盤藻目 | order | 原藻類 | -- | 圓篩藻綱 | 原藻界 |
| Streptothecaceae | family | 原藻類 | Streptothecaceae | 中型矽藻綱 | 原藻界 |